Ia merupakan lulusan Sekolah Inspektur Polisi Sumber Sarjana atau Sepa tahun 1988. Agus sempat mengikuti pendidikan Selapa tahun 2022, Sespim Polri tahun 2007, dan Sespimti tahun 2014.
Perjalanan karirnya dimulai dari bawah, diantaranya:
Pemeriksa Muda Puslabfor Bareskrim Polri (1991)
Panit Bahan Kimia Forensik Puslabfor Polri (1995)
Kanit Riksa Uang Palsu Subbid Upal Puslabfor Bareskrim Polri (2002)
Kasubbagren Set Puslabfor Bareskrim Polri (2006)
Wakalabforcab Palembang Bareskrim Polri (2008)
Analis Utama Puslabfor Bareskrim Polri (2010)
Kabiddokupalfor Puslabfor Bareskrim Polri (2010)
Kalaforcab Denpasar Bareskrim Polri (2012)
Kalaforcab Surabaya Bareskrim Polri (2014)
Kabagjemenmut Puslabfor Bareskrim Polri (2019)
Sekretaris Puslabfor Bareskrim Polri (2020)
Brigjen Pol Agus Budiharta diangkat menjadi Kapuslabfor Forensik Bareskrim Polri pada November 2020.***